Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1

Slana, Anita

prikaz prve stranice dokumenta Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1

Download
PDF 1004.22 KB

master's thesis

Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1

Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2017. urn:nbn:hr:217:578174

Slana, Anita

University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Cite this document

APA 6th Edition

Slana, A. (2017). Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1 (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

MLA 8th Edition

Slana, Anita. "Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

Chicago 17th Edition

Harvard

Slana, A. (2017). 'Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 23 January 2025, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

Vancouver

Slana A. Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1 [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2017 [cited 2025 January 23] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

IEEE

A. Slana, "Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2017. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

Cite this item: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:578174

Please login to the repository to save this object to your list.

Metadata

Title	Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1
Title (english)	Analysis of BACH2 gene promotor region methylation in infection with Human immunodeficiency virus type 1
Author	Anita Slana
Mentor	Petra Korać (mentor)
Mentor	Snježana Židovec Lepej (mentor)
Committee member	Petra Korać (predsjednik povjerenstva)
Committee member	Snježana Židovec Lepej (član povjerenstva)
Committee member	Goran Klobučar (član povjerenstva)
Committee member	Ana Galov (član povjerenstva)
Committee member	Maja Matulić (član povjerenstva)
Granter	University of Zagreb Faculty of Science (Department of Biology) Zagreb
Defense date and country	2017-05-22, Croatia
Scientific / art field, discipline and subdiscipline	NATURAL SCIENCES Biology
Abstract	Zaraza virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1 (HIV, eng. Human immunodeficiency virus type 1) povezuje se s progresivnim slabljenjem imunološkog sustava koje, ukoliko se ne liječi, uzrokuje smrt. Stanice podložne zarazi su limfociti CD4+. Tijekom infekcije dolazi do smanjenja njihovog broja u krvi HIV-pozitivnih osoba. Kao oblik liječenja HIV-pozitivnih pacijenata razvijena je antiretrovirusna terapija (ART) koja kombinira razne inhibitore virusnih proteina i dovodi do potpune supresije detektabilne viremije u pacijenata. Gen BACH2 je transkripcijski faktor koji ima ulogu u održavanju homeostaze perifernih naivnih T-limfocita, stvaranju efektorskih memorijskih T-stanica i regulaciji CD4+ senescencije. Cilj ovog istraživanja bio je analizirati razinu metilacije promotorske regije gena BACH2 kod HIV-om zaraženih osoba u odnosu na zdravu populaciju te utvrditi postoje li razlike u razini metilacije njegovog promotora koje ovise o statusu ispitanika. Ispitanici su podijeljeni u dvije skupine. Prvu skupinu činili su HIV-pozitivni pacijenti kod kojih se standardnim testovima ne može detektirati prisutnost virusnih kopija. Drugu skupinu činili su HIV-pozitivni pacijenti kod kojih je viremiju moguće detektirati te, u trenutku prikupljanja uzoraka krvi, nisu primali antiretrovirusnu terapiju. Metodom bisulfitne konverzije DNA i pirosekvenciranja odabranih regija promotora gena BACH2 određen je stupanj metilacije toga promotora. Utvrđeno je da kod obje skupine ispitanika dolazi do povećanja metilacije svih fragmenata promotorske regije u odnosu na kontrolnu zdravu skupinu što upućuje na to da hipermetilacija gena BACH2 dovodi do njegovog utišavanja koje ima ulogu u povećanju broja efektorskih T-stanica potrebnih za imunološki odgovor na zaražene stanice. Povećana metilacija CpG-otoka kod aviremičnih ispitanika može značiti trajnu promjenu u diferencijaciji T-stanica i homeostazi cijelog imunološkog sustava.
Abstract (english)	Infection with Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) leads to progressive deterioration of the immune system, and if untreated, leads to death. Cells susceptible to the infection are CD4+ lymphocytes. Their count diminishes in the blood of HIV-positive people during the infection. Antiretroviral therapy (ART) has been developed as a form of treatment and it combines different viral protein inhibitors and leads to total suppression of detectible viremia in patients. BACH2 gene codes for a transcription factor with a role in homeostasis of naïve T-lymphocytes, development of effector memory T-cells and regulating CD4+ senescence. The aim of this study was to analyse methylation of BACH2 promoter region in HIV-1 infected patients in relation to healthy population and determine if there are differences in methylation regarding patient status. Two groups of patients were included in this study. HIV-positive patients in whose blood no viral copies could be detected with standardised tests were first group. HIV-positive patients whose viremia could be detected and at the time of sampling were not receiving therapy were the second group. The level of gene promotor region methylation was detected using bisulfite conversion of the DNA and pyrosequencing. It was shown that both groups of HIV-positive patients have higher BACH2 methylation in relation to the control group. This finding suggests that there has been a hypermethylation and silencing of BACH2 gene that leads to an increase in number of effector T-cells needed for immunological response to infected cells. Hypermethylation of CpG-islands in aviremic patients could represent a permanent change in T-cell differentiation and homeostasis of the entire immune system.
Keywords
Keywords (english)
Language	croatian
URN:NBN	urn:nbn:hr:217:578174
Study programme	Title: Molecular Biology Study programme type: university Study level: graduate Academic / professional title: magistar/magistra molekularne biologije (magistar/magistra molekularne biologije)
Type of resource	Text
File origin	Born digital
Access conditions	Open access Embargo expiration date: 2018-05-22
Terms of use
Repository	Repository of the Faculty of Science
Created on	2017-07-14 08:55:37