Autofagija je katabolički proces u kojem stanica razgrađuje vlastite organele i proteine unutar lizosoma.Ovaj je proces bitan za očuvanje normalne fiziologije stanica u uvjetima stresa što uključuje uklanjanje oštećenih proteina i organela te pribavljanje alternativnog izvora energije u uvjetima gladovanja. Osim toga, autofagija ima bitnu ulogu u nastanku i razvitku tumora. Hoće li autofagija suprimirati tumore ili ih poticati ovisi o vrsti i stadiju napretka tumora. Do nedavno se smatralo da Beclin1, esencijalan protein za autofagiju, ima važnu ulogu u suprimiranju tumora, regulirajući autofagiju, međutim, ta je njegova uloga dovedena u pitanje novim istraživanjima. Autofagija može djelovati tumor supresijski na način da sprječava nekrozu koja potiče upalni odgovor, a time i proliferaciju stanica. Također može imati ulogu i u nastanku senescencije inducirane onkogenom te na taj način inhibira proliferaciju i tumorsku aktivnost. S druge strane, autofagija može poticati nastanak tumora na način da omogućava proliferaciju u uvjetima manjka kisika i nutrijenata ili sprječavanjem aktivacije mehanizma za popravak DNA. Tumori nastali RAS mutacijama u potpunosti su ovisni o autofagiji i ne preživljavaju ukoliko je inaktivirana. Gotovo sve danas poznate antitumorske terapije utječu na autofagiju. Neke je potiču, a neke inhibiraju. Također, autofagija djeluje na terapiju pospješujući je ili stvarajući otpornost tumorskih stanica. Točni mehanizmi djelovanja terapeutika na autofagiju i obrnuto još nisu poznati i potrebna su daljnja istraživanja na tu temu kako bi se moglo ciljano i učinkovito djelovati na autofagiju ili je koristiti kao oružje u borbi protiv tumora.