Glikozilacija je ključna posttranslacijska modifikacija čiji je utjecaj na funkciju proteina vjerojatno najbolje pokazan na primjeru imunoglobulina G (IgG). Budući je najzastupnije antitijelo u serumu i time lako dostupan, glikozilacija IgG-a vrlo je dobro opisana, kao i promjene u zastupljenosti pojedinih N-glikana IgG-a u raznim stanjima i bolestima, zbog čega IgG predstavlja odličan model glikoproteina. U svrhu daljnjeg rasvjetljavanja glikozilacije, razvijene su brojne metode koje omogućuju analizu slobodnih glikana te glikopeptida. Veliki izazov predstavlja prilagođavanje postojećih metoda uzorcima male količine glikoproteina za čiju je analizu potrebno razviti osjetljivije metode. Uzorci supernatanta staničnih kultura koje se ponekad koriste u istraživanju glikozilacije često sadrže vrlo male količine IgG-a u velikim volumenima medija jer su stanični modeli nerijetko loši proizvođači IgG-a. Obzirom da su postojeće metode za analizu glikozilacije IgG-a uglavnom optimizirane za uzorak plazme/seruma, bilo je potrebno uspostaviti protokol za analizu N-glikozilacije IgG-a iz početnih uzoraka male količine IgG-a u velikom volumenu, točnije, provjeriti mogu li se postojeće metode, uz manje modifikacije i optimizacije, koristiti u navedene svrhe. Optimiranjem pojedinih koraka uspostavljen je protokol koji se sastoji od izolacije IgG-a afinitetnom kromatografijom na ÄKTA Avant 25 sustavu uz CIM r-Protein G disk monolitnu kolonu, odsoljavanja eluiranog IgG-a hladnim metanolom, deglikozilacije izoliranog IgG-a pomoću PNGaze F, obilježavanje oslobođenih glikana APTS-om, pročišćavanja glikana na Bio-gel P-10 te analize glikana kapilarnom gel elektroforezom. Analizom uzoraka male količine IgG-a (1 – 10 µg) u volumenu od nekoliko desetaka mililitara staničnog medija ustanovljeno je da je osjetljivost uspostavljene metode dovoljna za analizu profila glikana porijeklom IgG-a količine od 3 µg. Za postizanje osjetljivosti dovoljne za analizu i manjh količina IgG-a (nanogramskih), potrebne su veće modifikacije metode poput odabira druge tehnike odsoljavanja proteina te dodatnog pročišćavanja i mogućnosti ukoncentriravanja obilježenih glikana.