prikaz prve stranice dokumenta Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj
  Download
PDF 1.61 MB
master's thesis
Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. urn:nbn:hr:217:936900
Žigrović, Dora
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Cite this document

Žigrović, D. (2019). Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Žigrović, Dora. "Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Žigrović, Dora. "Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Žigrović, D. (2019). 'Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 19 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Žigrović D. Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2019 [cited 2024 November 19] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

D. Žigrović, "Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2019. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Please login to the repository to save this object to your list.
Metadata
TitleMolekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj
Title (english)Molecular phylogeny and population genetics of roaches (genus Rutilus, Actinopteri) in Croatia
AuthorDora Žigrović
MentorIvana Buj (mentor)
Committee memberIvana Buj (predsjednik povjerenstva)
Committee memberIvan Radosavljević (član povjerenstva)
Committee memberDuje Lisičić (član povjerenstva)
Committee memberZoran Marčić (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2019-09-17, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Od ukupno četiri vrste roda Rutilus (Rutilus basak (Heckel, 1843), Rutilus aula (Bonaparte, 1841), Rutilus rutilus (Linnaeus, 1758), Rutilus virgo (Heckel, 1852)) koje možemo pronaći u Hrvatskoj, čak tri vrste (Rutilus basak, Rutilus aula i Rutilus virgo) su endemi. Iako vrste ovog roda nemaju nikakav status ugroženosti u Hrvatskoj, svojom brojnošću u sporim tekućicama i mirnim vodama itekako pridonose pravilnom funkcioniranju ekosustava. Cilj provedenog istraživanja bio je: objasniti srodstvene odnose pojedinih populacija i vrsta bodorki (rod Rutilus) u Hrvatskoj, ujedno i procijeniti evolucijska vremena divergencije pojedinih vrsta, opisati intraspecijsku i intrapopulacijsku gensku raznolikost, interspecijsku gensku različitost te u konačnici procijeniti efektivnu veličinu populacija i broj migranata po generaciji. Kako bi se utvrdili srodstveni odnosi među bodorkama u Hrvatskoj i njihov filogenetski položaj, filogenetska rekonstrukcija temeljena je na sekvencama za citokrom b (cyt b) pomoću tri metode: najveća parsimonija (MP), najveća vjerojatnost (ML) i metoda susjednog sparivanja (MJ). Dobivena filogenetska stabla i mreža potvrdili su razdvajanje svih četiri vrsta - vrste Rutilus rutilus u zasebnu liniju, kao i Rutilus virgo te odvajanje vrste Rutilus aula od vrste Rutilus basak. Prema dobivenoj procjeni, divergencija unutar roda Rutilus započela je u miocenskoj epohi i trajala je do pleistocenske epohe. Utvrđena je umjerena genska raznolikost vrste Rutilus aula, a visoka vrste Rutilus basak, a statistički testovi genske različitosti pokazali su genski iste populacije vrste Rutilus aula, a nešto različite vrste Rutilus basak. Procijenjene su male efektivne veličine populacija i nedostatak migracija među populacijama vrste Rutilus aula, dok su za vrstu Rutilus basak efektivne veličine nekih populacija veće, a nekih populacija manje uz migriranje jedinki između pojedinih populacija. Dobiveni rezultati mogli bi se koristiti kao podloga za daljnja istraživanja vrsta roda Rutilus u Hrvatskoj, ali i razmatranju njihovog statusa ugroženosti, kao i zaštite.
Abstract (english)
Out of four species of genus Rutilus (Rutilus basak (Heckel, 1843), Rutilus aula (Bonaparte, 1841), Rutilus rutilus (Linnaeus, 1758), Rutilus virgo (Heckel, 1852) which can be found in Croatia, three species (Rutilus basak, Rutilus aula and Rutilus virgo) are endems. Although species of this genus have no threat status in Croatia, density of their populations in slow streams and still waters contributes proper functioning of the ecosystems. The aim of this study was to: describe phylogenetc relationships of individual populations and species of the genus Rutilus in Croatia, evalute the evolutionary time periods of divergences of species of the genus Rutilus, describe intraspecific and intrapopulation genetic diversity, interspecific genetic differentiation and in the end evaluate their effective sizes and number of migrants per generation. To determine relations between roaches found in Croatia and their phylogenetic position, phylogenetic reconstruction based on cytochrome b (cyt b) sequences was conducted using following methods: maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and median joining (MJ). Phylogenetic trees and network revealed the separation of all four species – separation of Rutilus rutilus and Rutilus virgo and separation Rutilus basak from Rutilus aula. According to the estimate, divergence within the genus Rutilus began in the miocene and lasted until pleistocene epoch. Moderate genetic diversity od Rutilus aula and high of Rutilus basak are determined, furthermore statistic tests of genetic differentiation indicate the same genetic population of Rutilus aula and a little bit different populations in Rutilus basak. Small effective sizes and no migrations were estimated within populations of Rutilus aula and higher effective sizes of Rutilus basak populations with migrations between some populations. The results could be used in further researches of the genus Rutilus in Croatia, but also in consideration of their conservation status as well as protection.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:936900
Study programmeTitle: Experimental Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra eksperimentalne biologije (magistar/magistra eksperimentalne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Embargo expiration date: 2021-09-17
Terms of useLicence In copyright icon
RepositoryRepository of the Faculty of Science
Created on2019-10-14 09:38:58

(©) Nacionalna i sveučilišna knjižnica u Zagrebu 2015. Sva prava pridržana. | Hrvatske bratske zajednice 4 p.p. 550, 10000 Zagreb, Hrvatska Tel. ++ 385 1 616-4040
OIB: 84838770814 | IBAN: HR66 2340 0091 1000 1008 1, Porezni broj (PDV identifikacijski broj) - VAT Number: HR84838770814
Prijava u repozitorij