Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela

Žučko, Jurica

prikaz prve stranice dokumenta Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela

Pristup korisnicima matične ustanove

diplomski rad

Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela

Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2005. urn:nbn:hr:159:054195

Žučko, Jurica

Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
Zavod za biokemijsko inženjerstvo
Kabinet za bioinformatiku

Zatraži primjerak
dokumenta

Citirajte ovaj rad

APA 6th Edition

Žučko, J. (2005). Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

MLA 8th Edition

Žučko, Jurica. "Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2005. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

Chicago 17th Edition

Harvard

Žučko, J. (2005). 'Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, citirano: 07.02.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

Vancouver

Žučko J. Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet; 2005 [pristupljeno 07.02.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

IEEE

J. Žučko, "Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb, 2005. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:054195

Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.

Podaci o radu

Naslov	Predviđanje funkcija domena poliketidnih sintetaza pomoću skrivenih Markovljevih modela
Naslov (engleski)	Function prediction of polyketide synthase domains using hidden Markov models
Autor	Jurica Žučko
Mentor	Daslav Hranueli (mentor)
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj	Sveučilište u Zagrebu Prehrambeno-biotehnološki fakultet (Zavod za biokemijsko inženjerstvo) (Kabinet za bioinformatiku) Zagreb
Datum i država obrane	2005-06-13, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana	BIOTEHNIČKE ZNANOSTI Biotehnologija
Sažetak	Poliketidi su jedna od najčešće upotrebljavanih vrsta spojeva za dobivanje novih, biološki aktivnih supstancija. Razlog tome je način njihove biosinteze, koja se odvija u stupnjevima, pri čemu se u svakom stupnju poliketidni lanac produži za dva ugljikova atoma. Za dobivanje novih spojeva najčešće se upotrebljava postupak kombinatorne biosinteze, dodavanjem, uklanjanjem ili zamjenom domena ili modula poliketidnih sintetaza. Tim postupkom su dobiveni novi poliketidni spojevi, ali je njihov prinos u pravilu nizak. Kako taj problem nije razriješen, razvijen je novi postupak za dobivanje novih poliketida – mjesno-specifična mutageneza. Zamjenom pojedinih aminokiselina AT domena uspjela se promijeniti njihova specifičnost za supstrat. Matematički model, testiran u ovom radu, traži unutar višestrukog poravnanja domena stupce koji bi mogli imati važnu ulogu u određivanju funkcije domene. Zamjenom aminokiselina na tim pozicijama mogla bi se promijeniti funkcija domene.
Sažetak (engleski)	The polyketide natural products are a group of chemical compounds most frequently used to obtain new biologically active substances. The reason for that is their stepwise way of biosynthesis, where in each step the polyketide chain grows by two carbon atoms. Combinatorial biosynthesis is mostly used for obtaining new polyketides by adding, deleting or swapping domains or modules of the polyketide synthases. Numerous new compounds were synthesised using combinatorial biosynthesis, but the product titre was too low for commercial production. Since this problem has not been solved yet, a new approach using site-specific mutagenesis was developed. Until now the change of AT domain substrate specificity was achieved by substituting a few amino acids. The mathematical model tested in this work searches within multiple alignment for columns that might play an important role in determining the function of the domain. Changing the amino acids on those positions should alter the function of the domain.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezik	hrvatski
URN:NBN	urn:nbn:hr:159:054195
Studijski program	Naziv: Biotehnologija; smjerovi: Biokemijsko inženjerstvo Smjer: Biokemijsko inženjerstvo Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: dodiplomski Akademski / stručni naziv: diplomirani inženjer biotehnologije; smjer biokemijsko inženjerstvo (dipl. ing. bioteh.)
Vrsta resursa	Tekst
Način izrade datoteke	Izvorno digitalna
Prava pristupa	Pristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenja
Repozitorij	Repozitorij Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta u Zagrebu
Datum i vrijeme pohrane	2017-09-13 09:27:41