Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula

Šimatović, Ana

prikaz prve stranice dokumenta Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula

Preuzmi
PDF 775.46 KB

diplomski rad

Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula

Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. urn:nbn:hr:217:933768

Šimatović, Ana

Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

APA 6th Edition

Šimatović, A. (2009). Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

MLA 8th Edition

Šimatović, Ana. "Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Chicago 17th Edition

Harvard

Šimatović, A. (2009). 'Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Vancouver

Šimatović A. Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2009 [pristupljeno 22.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

IEEE

A. Šimatović, "Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2009. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.

Podaci o radu

Naslov	Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula
Naslov (engleski)	Structure and expression of genes for proteins Rad51 and Rad51D from marine sponge Suberites domuncula
Autor	Ana Šimatović
Mentor	Helena Ćetković (mentor)
Član povjerenstva	Mirjana Kalafatić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstva	Maja Matulić (član povjerenstva)
Član povjerenstva	Željka Vidaković Cifrek (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj	Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno-matematički fakultet (Biološki odsjek) Zagreb
Datum i država obrane	2009, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana	PRIRODNE ZNANOSTI Biologija
Sažetak	Proteini od interesa, Rad51 i Rad51D, imaju vrlo važnu ulogu kod sisavaca u održavanju integriteta genoma. Postojanje ovih proteina utvrđeno je i kod drugih kralježnjaka, te kod beskralježnjaka. Modelni organizam, morska spužva Suberites domuncula pripada koljenu Porifera, najstarijim danas živućim mnogostaničnim organizmima, i stoga je vrlo zanimljiva za istraživanje evolucijski sačuvanih gena/proteina. Metodama umnožavanja DNA lančanom reakcijom polimeraze i određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA Sangerovom dideoksi metodom utvrđen je nukleotidni slijed gena rad51 i rad51D te položaj introna. Pomoću algoritma BLAST i programa Clustal X i GeneDoc uspoređene su dobivene proteinske sekvence s njihovim ortolozima u drugim organizmima. Proteinske sekvence i položaj introna očekivano pokazuju veću homologiju s ortolozima iz kralježnjaka, nego iz beskralježnjaka. Gen rad51D ukloniran je u ekspresijski vektor kojim su transformirane stanice BL21. Nedovoljna koncentracija proteina se zadržava u topljivoj fazi, većina odlazi u talog gdje se agregira u obliku inkluzijskih tijela.
Sažetak (engleski)	The proteins of interest, Rad51 and Rad51D play a very important part in maintaining mammalian genome integrity. The existence of these proteins was detected in other vertebrates, as well as in invertebrates. The model organism, marine sponge Suberites domuncula belongs to the phylum Porifera, the oldest living Metazoa. Therefore, the study of its genes/proteins that have been conserved through evolution is very interesting. Polymerase chaine reaction for multiplying DNA and Sanger dideoxynucleotide sequencing method were used in order to determine the nucleotide sequence for genes rad51 and rad51D and their intron position. Using BLAST searches of GenBank database and Clustal X and GeneDoc programmes, the obtained protein sequences were compared to their orthologs in other organisms. As expected, the protein sequences and intron position show more homology with their vertebrate orthologs than with their invertebrate orthologs. The rad51D gene was cloned into the expression vector which was used to transform BL21 cells. Insufficient protein concentration is contained in the supernatant, due to the fact that most proteins sediment and aggregate to form inclusion bodies.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezik	hrvatski
URN:NBN	urn:nbn:hr:217:933768
Studijski program	Naziv: Diplomirani inženjer biologije; smjerovi: Molekularna biologija Smjer: Molekularna biologija Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: dodiplomski Akademski / stručni naziv: magistar/magistra biologije (mag. biol.)
Vrsta resursa	Tekst
Način izrade datoteke	Izvorno digitalna
Prava pristupa	Otvoreni pristup
Uvjeti korištenja
Repozitorij	Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta
Datum i vrijeme pohrane	2018-03-21 09:33:37