Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj

Žigrović, Dora

prikaz prve stranice dokumenta Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj

Preuzmi
PDF 1.61 MB

diplomski rad

Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj

Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. urn:nbn:hr:217:936900

Žigrović, Dora

Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

APA 6th Edition

Žigrović, D. (2019). Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

MLA 8th Edition

Žigrović, Dora. "Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Chicago 17th Edition

Harvard

Žigrović, D. (2019). 'Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 20.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Vancouver

Žigrović D. Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2019 [pristupljeno 20.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

IEEE

D. Žigrović, "Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:936900

Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.

Podaci o radu

Naslov	Molekularna filogenija i populacijska genetika bodorki (rod Rutilus; Actinopteri) u Hrvatskoj
Naslov (engleski)	Molecular phylogeny and population genetics of roaches (genus Rutilus, Actinopteri) in Croatia
Autor	Dora Žigrović
Mentor	Ivana Buj (mentor)
Član povjerenstva	Ivana Buj (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstva	Ivan Radosavljević (član povjerenstva)
Član povjerenstva	Duje Lisičić (član povjerenstva)
Član povjerenstva	Zoran Marčić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj	Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno-matematički fakultet (Biološki odsjek) Zagreb
Datum i država obrane	2019-09-17, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana	PRIRODNE ZNANOSTI Biologija
Sažetak	Od ukupno četiri vrste roda Rutilus (Rutilus basak (Heckel, 1843), Rutilus aula (Bonaparte, 1841), Rutilus rutilus (Linnaeus, 1758), Rutilus virgo (Heckel, 1852)) koje možemo pronaći u Hrvatskoj, čak tri vrste (Rutilus basak, Rutilus aula i Rutilus virgo) su endemi. Iako vrste ovog roda nemaju nikakav status ugroženosti u Hrvatskoj, svojom brojnošću u sporim tekućicama i mirnim vodama itekako pridonose pravilnom funkcioniranju ekosustava. Cilj provedenog istraživanja bio je: objasniti srodstvene odnose pojedinih populacija i vrsta bodorki (rod Rutilus) u Hrvatskoj, ujedno i procijeniti evolucijska vremena divergencije pojedinih vrsta, opisati intraspecijsku i intrapopulacijsku gensku raznolikost, interspecijsku gensku različitost te u konačnici procijeniti efektivnu veličinu populacija i broj migranata po generaciji. Kako bi se utvrdili srodstveni odnosi među bodorkama u Hrvatskoj i njihov filogenetski položaj, filogenetska rekonstrukcija temeljena je na sekvencama za citokrom b (cyt b) pomoću tri metode: najveća parsimonija (MP), najveća vjerojatnost (ML) i metoda susjednog sparivanja (MJ). Dobivena filogenetska stabla i mreža potvrdili su razdvajanje svih četiri vrsta - vrste Rutilus rutilus u zasebnu liniju, kao i Rutilus virgo te odvajanje vrste Rutilus aula od vrste Rutilus basak. Prema dobivenoj procjeni, divergencija unutar roda Rutilus započela je u miocenskoj epohi i trajala je do pleistocenske epohe. Utvrđena je umjerena genska raznolikost vrste Rutilus aula, a visoka vrste Rutilus basak, a statistički testovi genske različitosti pokazali su genski iste populacije vrste Rutilus aula, a nešto različite vrste Rutilus basak. Procijenjene su male efektivne veličine populacija i nedostatak migracija među populacijama vrste Rutilus aula, dok su za vrstu Rutilus basak efektivne veličine nekih populacija veće, a nekih populacija manje uz migriranje jedinki između pojedinih populacija. Dobiveni rezultati mogli bi se koristiti kao podloga za daljnja istraživanja vrsta roda Rutilus u Hrvatskoj, ali i razmatranju njihovog statusa ugroženosti, kao i zaštite.
Sažetak (engleski)	Out of four species of genus Rutilus (Rutilus basak (Heckel, 1843), Rutilus aula (Bonaparte, 1841), Rutilus rutilus (Linnaeus, 1758), Rutilus virgo (Heckel, 1852) which can be found in Croatia, three species (Rutilus basak, Rutilus aula and Rutilus virgo) are endems. Although species of this genus have no threat status in Croatia, density of their populations in slow streams and still waters contributes proper functioning of the ecosystems. The aim of this study was to: describe phylogenetc relationships of individual populations and species of the genus Rutilus in Croatia, evalute the evolutionary time periods of divergences of species of the genus Rutilus, describe intraspecific and intrapopulation genetic diversity, interspecific genetic differentiation and in the end evaluate their effective sizes and number of migrants per generation. To determine relations between roaches found in Croatia and their phylogenetic position, phylogenetic reconstruction based on cytochrome b (cyt b) sequences was conducted using following methods: maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and median joining (MJ). Phylogenetic trees and network revealed the separation of all four species – separation of Rutilus rutilus and Rutilus virgo and separation Rutilus basak from Rutilus aula. According to the estimate, divergence within the genus Rutilus began in the miocene and lasted until pleistocene epoch. Moderate genetic diversity od Rutilus aula and high of Rutilus basak are determined, furthermore statistic tests of genetic differentiation indicate the same genetic population of Rutilus aula and a little bit different populations in Rutilus basak. Small effective sizes and no migrations were estimated within populations of Rutilus aula and higher effective sizes of Rutilus basak populations with migrations between some populations. The results could be used in further researches of the genus Rutilus in Croatia, but also in consideration of their conservation status as well as protection.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezik	hrvatski
URN:NBN	urn:nbn:hr:217:936900
Studijski program	Naziv: Eksperimentalna biologija Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: diplomski Akademski / stručni naziv: magistar/magistra eksperimentalne biologije (mag. biol. exp.)
Vrsta resursa	Tekst
Način izrade datoteke	Izvorno digitalna
Prava pristupa	Otvoreni pristup Datum isteka embarga: 2021-09-17
Uvjeti korištenja
Repozitorij	Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta
Datum i vrijeme pohrane	2019-10-14 09:38:58